Док парадајз смеђи воћни вирус заражава биљке парадајза и паприке широм света, семенске компаније раде на узгоју отпорног парадајза.
Богати генетски и геномски ресурси били су на располагању узгајивачима парадајза чак и пре почетка пројеката геномског секвенцирања парадајза. Велике колекције парадајзне гермплазме су одавно успостављене на неколико локација. Више од 75,000 придружених парадајза чува се у генетским банкама широм света. Једна од највећих је УСДА генска банка у Женеви, Њујорк.
Секвенцирање генома парадајза покренуто је 2005. године као мултинационални напор између 14 земаља и завршено 2012. Ови напори су знатно убрзани применом вештачке интелигенције, машинског учења и напредних алгоритама за анализу великих количина генетских и фенотипских података.
Парадајз Пан-геном
Истраживачи са Института Боице Тхомпсон 2020. године створили су висококвалитетни референтни геном за дивљи парадајз како би произвели потпунији и кориснији пан-геном парадајза. Открили су делове генома који су у основи укуса, величине и зрења воћа, толеранције на стрес и отпорности на болести. Делимично захваљујући најсавременијим технологијама секвенцирања које могу читати веома дугачке делове ДНК, референтни геном је потпунији и тачнији од постојеће базе података.
Старије технологије секвенцирања које читају краће комаде ДНК идентификују мутације на једнобазном нивоу. Међутим, нису добри у проналажењу структурних варијанти попут уметања, брисања, инверзије или дуплирања великих делова ДНК.
Године 2019. међународна група истраживача конструисала је пан-геном парадајза користећи секвенце генома од 725 филогенетски и географски репрезентативних сорти. Ова база података укључује 4,873 гена који нису пронађени у оригиналном референтном геному. Садашње / одсутне анализе варијација откриле су значајан губитак гена и интензиван негативан одабир гена и промотора током припитомљавања и побољшања парадајза.
Прочитајте цео чланак на ввв.сеедворлд.цом.